Sequenciamento genômico do SARS-CoV-2. Guia de implementação para máximo impacto na saúde pública. 8 de janeiro de 2021

Avanços recentes permitiram que os genomas do coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2) – o agente causador da COVID-19 – fossem sequenciados horas ou dias após a identificação de um caso. Como resultado, pela primeira vez, o sequenciamento genômico em tempo real foi capaz de orientar a resposta da saúde pública a uma pandemia. O sequenciamento metagenômico foi fundamental para a detecção e caracterização do novo patógeno. O compartilhamento precoce das sequências do genoma do SARS-CoV-2 permitiu que ensaios de diagnóstico molecular fossem desenvolvidos rapidamente, o que melhorou a preparação global e contribuiu para o projeto de contramedidas. O sequenciamento rápido e em grande escala do genoma do vírus está contribuindo para a compreensão da dinâmica das epidemias virais e para a avaliação da eficácia das medidas de controle. Este guia tem como objetivo ajudar os técnicos e laboratórios de saúde pública responsáveis por programas de sequenciamento genômico para o SARS-CoV-2 ou que estejam cogitando o estabelecimento desses programas. Ele fornece informações sobre as considerações a serem feitas ao se planejar ou conduzir um programa de sequenciamento do SARS-CoV-2, de modo a garantir o melhor uso dos resultados na melhoria da saúde pública. Além disso, levanta questões práticas, detalha as possíveis aplicações e limitações das análises genômicas e fornece uma breve orientação sobre estratégias técnicas para sequenciamento e análise.